Что надо знать о туляремии (памятка для населения)

Туляремия – инфекционное заболевание, источниками которого являются различные виды диких животных. В природных условиях туляремией болеют более 60 видов мелких млекопитающих, главным образом — грызуны (водяные крысы, полёвки, мыши и т.д.).

Больные зверьки своими выделениями заражают окружающую среду, пищевые продукты, овощи, зерно, сено, предметы домашнего обихода. Попадая в непроточные водоёмы (озёра, пруды и т.д.), они заражают воду.

Возбудителем туляремии является микроб (бактерия), который обладает высокой устойчивостью во внешней среде: в воде и сырой почве при низкой температуре способен выживать и вызывать заболевание людей в течение трёх месяцев и более.

На территории Удмуртской Республики в течение ряда лет эпидемиологическая обстановка по туляремии сохраняется стабильной. Последний случай заболевания туляремией был зарегистрирован в 1997 году в г.Ижевске.

Актуальность проблемы профилактики туляремии определяется наличием малоактивных природных очагов этой инфекции, эпизоотическая активность которых подтверждается периодическим обнаружением положительных на туляремию проб из объектов окружающей среды. По результатам многолетнего мониторинга к энзоотичным (с множественным неоднократным обнаружением возбудителя в пробах полевого материала) территориям по туляремии относятся: Алнашский, Каракулинский, Киясовский, Мало-Пургинский, Можгинский, Сарапульский, Увинский, Шарканский, Ярский районы. Менее активными территориями (с единичным обнаружением возбудителя в пробах полевого материала) являются Вавожский, Воткинский, Граховский, Дебесский, Игринский, Завьяловский, Камбарский, Кизнерский, Як-Бодьинский районы.

Ежегодно ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Удмуртской Республике» проводятся около 800 исследований проб объектов окружающей среды на туляремию (в том числе клещей, слепней, погадок и подснежных гнезд хищных птиц, грызунов). Удельный вес положительных результатов в среднем составляет около 6%, при этом наибольшая доля проб с обнаружением возбудителя отмечается при исследовании погадок хищных птиц.

Существующие на территории Удмуртской Республики природные очаги туляремии поддерживаются в активном состоянии благодаря наличию мелких млекопитающих (мышевидных грызунов), а также других переносчиков (клещи, слепни, и другие членистоногие).

Человек чрезвычайно восприимчив к туляремии и заражается различными путями:

— через кожу, в том числе неповреждённую, при контакте с больными зверьками и их трупами;

— через дыхательные пути при переборке сена, соломы, овощей и др. сельскохозяйственных продуктов;

— через конъюнктиву глаз при умывании водой из заражённого водоёма или занесения микроба в глаз грязными руками;

— через пищеварительный тракт, при употреблении заражённой воды для питья или недостаточно проваренного мяса зайцев и др. мелких млекопитающих;

— при укусах кровососущими насекомыми (комары, слепни, клещи).

Наиболее часто заражение туляремией происходит при укусе заражёнными комарами, слепнями и клещами в природных очагах инфекций.

Клинические проявления болезни появляются спустя 3-6 дней после заражения. Заболевание начинается внезапно: повышается температура тела до 39-40 градусов, появляется сильная головная боль, резкая слабость, боли в мышцах, сильная потливость по ночам. Заболевание сопровождается болезненностью и увеличением лимфатических узлов в какой-либо определённой части тела (в области шеи, под мышкой, в паху) всегда вблизи того места, где микробы проникли в организм. Если заражение произошло через кожу, то в месте проникновения микробов появляется покраснение, нагноение, язва, одновременно увеличивается и становиться болезненным ближайший лимфатический узел. Если заражение произошло через слизистые оболочки глаза, развивается конъюнктивит и лимфаденит околоушных и подчелюстных лимфоузлов. При попадании возбудителя в организм через дыхательные пути развивается воспаление лёгких, через рот, в миндалины – ангина с резким увеличением подчелюстных и шейных лимфатических узлов.

Для профилактики заражения не рекомендуется:

• пить воду из открытых водоёмов или неблагоустроенных колодцев на дачных участках;

• располагаться на отдых в стогах сена (соломы), излюбленного места обитания грызунов;

• ловить диких зверьков и брать в руки трупы мелких млекопитающих;

• купаться в непроточных водоёмах на неизвестной территории, где возможно нахождение природного очага туляремии.

Необходимо применять репелленты против укусов комаров, слепней, клещей-переносчиков туляремии.

Надежная защита от туляремии – вакцинопрофилактика. Прививка надёжно защищает от заражения в течение 5 лет. На территории Удмуртской Республики группы «профессионального риска» (работники зерно- и овощехранилищ, льнозаводов, животноводческих и птицеводческих ферм, работающие с зерном и фуражом, заготовители шкур животных, охотники, работники лабораторий особо опасных инфекций) прививаются бесплатно.

Важно!

При подозрении на заболевание необходимо немедленно обратиться к врачу.

Туляремия. Памятка для населения | Советы специалистов | Тематические страницы

Туляремия. Памятка для населения

Туляремия — природно-очаговая инфекция, передаваемая от животных.

Возбудитель заболевания — мелкая бактерия Francisella tularensis. Возбудитель туляремии характеризуется высокой устойчивостью в окружающей среде, особенно при низких температурах и высокой влажности (выживает при −30 C, сохраняется во льду до 10 месяцев, в мороженом мясе до 3 месяцев), менее устойчив к высыханию (в шкурках павших от туляремии грызунов сохраняется до 1,5 месяцев при комнатной температуре и до 1 недели при температуре 30 C). Остается жизнеспособным в речной воде при температуре 10 C до 9 месяцев, в почве до 2,5-4 месяцев, на зерне, соломе при температуре −5 C до 190 дней, при 8 C до 2 месяцев, при 20-30С до 3 недель. Длительно сохраняется в молоке, сливках при низких температурах. Малоустойчив к высоким температурам (при 60 C погибает через 5-10 минут, при 100 С — в течение 1-2 минут), солнечному свету, УФ-лучам, дезинфицирующим средствам (растворы лизола, хлорамина, хлорной извести убивают его за 3-5 минут).

Природные очаги туляремии распространены на всех континентах Северного полушария в Европе, Азии и Северной Америке.

Рост заболеваемости наблюдается в годы повышения численности грызунов.

Носители палочки туляремии — зайцы, кролики, водяные крысы, полевки. В природных очагах периодически возникают эпизоотии. Инфекция передается человеку или непосредственно при контакте с животными (охота), или через заражённые пищевые продукты и воду, реже аспирационным путем (при дыхании — при обработке зерновых и фуражных продуктов, обмолоте хлеба), кровососущими членистоногими (слепень, клещ, комар и др.).

Клинические проявления заболевания.

Инкубационный период от нескольких часов до 3-7 дней. Различают бубонную, легочную и генерализованную (распространенную по организму) формы. Болезнь начинается остро с внезапного подъёма температуры до 38,5-40С. Появляется резкая головная боль, головокружение, боли в мышцах ног, спины и поясничной области, потеря аппетита. В тяжелых случаях может быть рвота, носовые кровотечения. Характерны выраженная потливость, нарушение сна в виде бессонницы или наоборот сонливости. Часто наблюдается эйфория и повышение активности на фоне высокой температуры. Отмечается покраснение и отечность лица и конъюнктивы уже в первые дни болезни. Позднее на слизистой оболочке полости рта появляются точечные кровоизлияния. Язык обложен сероватым налетом. Характерный признак — увеличение различных лимфатических узлов, размеры которых могут быть от горошины до грецкого ореха. Боли в животе возможны при значительном увеличении лимфатических узлов брюшной полости. Со стороны сердечно-сосудистой системы отмечается урежение сердцебиений, снижение артериального давления. Лихорадка длится от 6 до 30 дней.

При бубонной форме туляремии возбудитель проникает через кожу, не оставляя следа, через 2-3 дня болезни развивается воспаление регионарных лимфатических узлов (лимфаденит). Бубоны мало болезненны и имеют чёткие контуры величиной до 5 см. В дальнейшем происходит либо размягчение бубона (1-4 мес.), либо его самопроизвольное вскрытие с выделением густого сливкообразного гноя и образованием туляремийного свища. Чаще поражаются подмышечные, паховые и бедренные лимфатические узлы. Язвенно-бубонная форма характеризуется наличием первичного поражения на месте входных ворот инфекции.

Глазо-бубонная форма развивается при попадании возбудителя на слизистые оболочки глаз. Типично появление пузырьковых разрастаний желтого цвета размером до просяного зерна на конъюнктиве. Бубон развивается в околоушных или подчелюстных областях, течение болезни длительное.

Ангинозно-бубонная форма возникает при первичном поражении слизистой оболочки миндалин, обычно одной. Встречается при пищевом пути заражения. Есть формы туляремии с преимущественным поражением внутренних органов.

Легочная форма — чаще регистрируется в осенне-зимний период.

Генерализованная форма протекает по типу общей инфекции с выраженным токсикозом, потерей сознания, бредом, сильной головной и мышечной болями.

Осложнения могут быть специфические (вторичная туляремийная пневмония, перитонит, перикардит, менингоэнцефалит), а также абсцессы, гангрены, обусловленные вторичной бактериальной флорой.

Диагностика основывается на кожноаллергической пробе и серологических (иммунологических) реакциях. Больных с туляремией или подозрением на неё следует госпитализировать.

Профилактика. Предусматривает контроль за природными очагами туляремии, своевременное выявление вспышек заболеваний среди диких животных, проведение мероприятий по борьбе с крысами и насекомыми.

В случае заболевания людей устанавливаются источники возбудителя инфекции и обстоятельства заражения. При водной вспышке необходимо запретить употребление некипяченой воды; при трансмиссивном заражении (укус насекомых) временно ограничивают посещение мест, где оно могло произойти

Специфическая профилактика (вакцинация) проводится живой туляремийной вакциной. Вакцина через 20-30 дней обеспечивает развитие иммунитета до 5 лет.

Прививкам подлежит население, проживающее на неблагополучных по туляремии территориях и выполняющие следующие виды работ: сельскохозяйственные, строительные, гидромелиоративные, работы по выемке и перемещению грунта, заготовительные, промысловые, геологические, изыскательные, экспедиционные, дератизационные и дезинсекционные; по лесозаготовке, расчистке и благоустройству леса, зон оздоровления и отдыха населения.

Новое на сайте

Туляремия. Профилактика и лечение. Памятка для населения

          Туляремия – острая зоонозная природно-очаговая болезнь. Возбудитель — бактерия. Она может длительно сохраняться в воде, молоке, высокочувствительна к солнечному свету, ультрафиолетовым лучам, высокой температуре и к действию дезинфицирующих средств, но при кипячении погибает через 1-2 минуты. Возбудитель туляремии является одним из наиболее высоко патогенных микроорганизмов. Он проявляет значительную выживаемость во внешней среде, особенно в низких температурах, и сохраняет жизнеспособность от нескольких суток до 10 месяцев.

            Для человека основные источники инфекции – водяные крысы, ондатры, зайцы, мыши. В организм возбудитель проникает через микротравмы кожи, слизистую оболочку ротоглотки, дыхательных путей, глаз.

Механизмы заражения при туляремии:

             — трансмиссивный – заражение человека осуществляется в результате укуса инфицированными кровососущими (комарами, слепнями, клещами, мухами-жигалками).

            — контактный – через поврежденные и неповрежденные кожные и слизистые покровы при соприкосновении с больными или павшими грызунами и зайцами.

            — алиментарный – при употреблении продуктов питания, сельхозпродуктов и воды (колодезной и других открытых водоемов), инфицированных возбудителем туляремии от больных грызунов.

            — аэрозольный – при вдыхании пыли во время переработки зерна, перекладки сена, соломы, инфицированных возбудителем туляремии от больных грызунов.

            Восприимчивость почти 100%, после перенесенной болезни остается стойкий иммунитет.

            Инкубационный период, как правило, составляет 3-7 дней, заболевание продолжается 2-3 недели (иногда дольше), в ряде случаев может рецидивировать. Болезнь начинается остро, с озноба, повышение температуры тела до 38-400 С, характерна сильная головная боль, слабость. Наиболее характерными признаками туляремии считают воспаление лимфатических узлов различной локализации. Редко наблюдается генерализованная форма болезни. Эта форма характеризуется волнообразной лихорадкой, интоксикацией, поражением нервной и сердечнососудистой системы, высыпаниями на коже. Часто осложняется вторичной пневмонией, менингитом, миокардитом.

            Больной человек не может быть источником инфекции для окружающих. От человека к человеку это заболевание не передается.       Больных с подозрением на туляремию госпитализируют по клиническим показаниям. В остром периоде заболевания необходим постельный режим и полноценное питание, обогащенное витаминами.

            Прогноз при часто встречающихся формах болезни благоприятный, при легочной и генерализованной формах — серьезный. Летальность не превышает 0,5 -1%. Диспансерное наблюдение после перенесенного заболевания 1,5 — 2 года.

            Самая эффективная мера борьбы с туляремией — это проведение профилактических прививок против туляремии. Прививка безболезненна, проводят ее взрослым и детям старше 7 лет. Прививка защищает от болезни в течение 5 лет. Прививки можно сделать в лечебной организации по месту жительства.

            Кроме прививок должны проводиться следующие мероприятия:

• Защита от грызунов колодцев, родников, пищевых продуктов.
• Исключать употребление для питья сырой воды из случайных водоисточников.
• Борьба с грызунами на предприятиях, в жилых помещениях и хозяйственных постройках, на садово-огородных участках.
• Использование реппелентов (средств защиты от укусов комаров, слепней, клещей) во время работы или отдыха на природе.
• При посещении леса, сборе ягод, грибов и т.п. следует проводить само- и взаимоосмотры, для раннего выявления клещей.

            Снятие шкурок и потрошение зайцев, ондатр, кротов и водяных крыс проводить в резиновых перчатках. Если работы проводятся без резиновых перчаток, необходимо обязательно дезинфицировать руки после их окончания.

Брянск | Памятка для населения. Профилактика туляремии

Центр


Белгородская область
Брянская область
Владимирская область
Воронежская область
г. Москва
Ивановская область
Калужская область
Костромская область
Курская область
Липецкая область
Московская область
Орловская область
Рязанская область
Смоленская область
Тамбовская область
Тверская область
Тульская область
Ярославская область

Приволжье


Кировская область
Нижегородская область
Оренбургская область
Пензенская область
Пермский край
Республика Башкортостан
Республика Марий Эл
Республика Мордовия
Республика Татарстан
Самарская область
Саратовская область
Удмуртская Республика
Ульяновская область
Чувашская Республика

Сибирь


Алтайский край
Забайкальский край
Иркутская область
Кемеровская область
Красноярский край
Новосибирская область
Омская область
Республика Алтай
Республика Бурятия
Республика Тыва
Республика Хакасия
Томская область

Урал


Курганская область
Свердловская область
Тюменская область
Ханты-Мансийский автономный округ
Челябинская область
Ямало-Ненецкий автономный округ

Юг


Астраханская область
Волгоградская область
г. Севастополь
Краснодарский край
Республика Адыгея
Республика Калмыкия
Республика Крым
Ростовская область

Северо-Запад


Архангельская область
Вологодская область
г. Санкт-Петербург
Калининградская область
Ленинградская область
Мурманская область
Ненецкий автономный округ
Новгородская область
Псковская область
Республика Карелия

Туляремия. Памятка для населения

Туляремия — природно-очаговая инфекция, передаваемая от животных.
Возбудитель заболевания — мелкая бактерия Francisella tularensis. 
Носители палочки туляремии — зайцы, кролики, водяные крысы, полевки. Инфекция передается человеку или непосредственно при контакте с животными (охота), или через заражённые пищевые продукты и воду, реже аспирационным путем (при дыхании — при обработке зерновых продуктов, обмолоте хлеба), кровососущими членистоногими (слепень, клещ, комар и др.).

Клинические проявления заболевания.

Инкубационный период от нескольких часов до 3-7 дней. Различают бубонную, легочную и генерализованную (распространенную по организму) формы. Болезнь начинается остро с внезапного подъёма температуры до 38,5-40°С. Появляется резкая головная боль, головокружение, боли в мышцах ног, спины и поясничной области, потеря аппетита. В тяжелых случаях может быть рвота, носовые кровотечения. Характерны выраженная потливость, нарушение сна в виде бессонницы или наоборот сонливости. Язык обложен сероватым налетом. Характерный признак — увеличение различных лимфатических узлов, размеры которых могут быть от горошины до грецкого ореха. Боли в животе возможны при значительном увеличении лимфатических узлов брюшной полости.

Осложнения могут быть специфические (вторичная туляремийная пневмония, перитонит, перикардит, менингоэнцефалит), а также абсцессы, гангрены, обусловленные вторичной бактериальной флорой.

Диагностика основывается на кожноаллергической пробе и серологических (иммунологических) реакциях. Больных с туляремией или подозрением на неё следует госпитализировать.

Профилактика.

Предусматривает контроль за природными очагами туляремии, своевременное выявление вспышек заболеваний среди диких животных, проведение мероприятий по борьбе с крысами и насекомыми.

В случае заболевания людей устанавливаются источники возбудителя инфекции и обстоятельства заражения. При водной вспышке необходимо запретить употребление некипяченой воды; при трансмиссивном заражении (укус насекомых) временно ограничивают посещение мест, где оно могло произойти.

Специфическая профилактика (вакцинация)проводится живой туляремийной вакциной. Накожно или в/к, однократно.

Вакцина через 20-30 дней обеспечивает развитие иммунитета до 5 лет. Прививкам подлежит население, проживающее на неблагополучных по туляремии территориях и выполняющие следующие виды работ: сельскохозяйственные, строительные, гидромелиоративные, работы по выемке и перемещению грунта, заготовительные, промысловые, геологические, изыскательные, экспедиционные, дератизационные и дезинсекционные; по лесозаготовке, расчистке и благоустройству леса, зон оздоровления и отдыха населения.

ПРОФИЛАКТИКА ТУЛЯРЕМИИ. ПАМЯТКА. | ГБУ РО «Ермишинская районная больница»

Туляремия – острая зоонозная природно-очаговая болезнь. Относится к распространенным инфекционным болезням и встречается в виде, как отдельных спорадических случаев, так и эпидемических вспышек. Природные очаги туляремии имеются в Европейской части РФ, в Западной и Восточной Сибири. Возбудитель мелкая неподвижная
грамотрицательная палочка, устойчивая в окружающей среде. Палочка может длительно сохраняться в воде, молоке, высокочувствительна к солнечному свету, ультрафиолетовым лучам, высокой температуре и к действию дезинфицирующих средств. Возбудитель туляремии является одним из наиболее высоко патогенных микроорганизмов. Он проявляет значительную выживаемость во внешней среде, особенно в низких температурах, и сохраняет жизнеспособность от нескольких суток до 10 месяцев.

Для человека основные источники инфекции – водяные крысы, ондатры, зайцы, мыши. В организм возбудитель проникает через микротравмы кожи, слизистую оболочку ротоглотки, дыхательных путей, глаз.

Механизмы заражения при туляремии:

Трансмиссивный – заражение человека осуществляется в результате укуса инфицированными кровососущими (комарами, слепнями, клещами, мухами-жигалками).

Контактный – через поврежденные и неповрежденные кожные и слизистые покровы при соприкосновении с больными или павшими грызунами и зайцами.

Алиментарный – при употреблении продуктов питания, сельхозпродуктов и воды (колодезной и других открытых водоемов), контаминированных возбудителем туляремии от больных грызунов.

Аэрозольный – при вдыхании пыли во время переработке зерна, перекладке сена, соломы, контаминированных возбудителем туляремии от больных грызунов.

Болеют преимущественно сельские жители и горожане, живущие на окраине городов или выезжающие на рыбалку, охоту, купание. Восприимчивость почти 100%, после перенесенной болезни остается стойкий иммунитет.

Клиника:

Инкубационный период, как правило, составляет 3-7 дней, заболевание продолжается 2-3 недели (иногда дольше), в ряде случаев может рецидивировать.

Болезнь начинается остро, с озноба, повышение температуры тела до 38-40С, характерна сильная головная боль, слабость. Лицо больного гиперемировано, одутловатое, язык обложен. Наиболее характерными признаками туляремии считают лимфаденит (воспаление лимфатических узлов) различной локализации. Редко наблюдается генерализованная форма болезни. Эта форма характеризуется волнообразной лихорадкой, интоксикацией, поражением нервной и сердечнососудистой системы, высыпаниями на коже. Часто осложняется вторичной пневмонией, менингитом, миокардитом.

Больной человек не может быть источником инфекции для окружающих. От человека к человеку это заболевание не передается.

Больных с подозрением на туляремию госпитализируют по клиническим показаниям. В остром периоде заболевания необходим постельный режим и полноценное питание, обогащенное витаминами.

Прогноз при часто встречающихся формах болезни благоприятный, при легочной и генерализованной формах — серьезный. Летальность не превышает 0,5 -1% . Диспансерное наблюдение после перенесенного заболевания 1,5-2 года.

Профилактика направлена на борьбу с грызунами, уничтожение их в складах, амбарах, жилищах, на защиту от проникновения в жилые, складские помещения и борьбу с членистоногими- переносчиками возбудителя.

Вакцинацию против туляремии проводят населению, проживающему на неблагополучных по туляремии территориях, а также лицам, подвергающимся риску заражения этой инфекцией, занятым на полевых и лесных работах, обработкой меха, лабораторной работой с животными и материалом, подозрительным на инфицирование возбудителем туляремии и др.. Вакцинацию сухой живой туляремийной вакциной осуществляют медицинские работники поликлиник. Длительность иммунитета после вакцинации – 5 лет.

материал подготовил зав. поликлиникой, врач-терапевт М. Зотов

Памятка по профилактике туляремии | МУЗ Родильный дом

Туляремия — это природно-очаговое, острое инфекционное заболевание, характеризующееся явлениями лихорадки, поражением лимфатических узлов и других органов, в зависимости от входных ворот инфекции (глаз, легких, кожи, желудочно-кишечного тракта и др.). Туляремия вызывается бактериями, которые длительное время могут существовать во внешней среде: в воде при +13° С – +15°С. Сохраняются до 3-х месяцев; в зерне, соломе при температуре ниже 0˚ не менее 6 месяцев, в шкурах водяных крыс при +20°С – 25°С до месяца.

Источники инфекции: водяная крыса, ондатра, зайцы, все виды полевок и мышей. Большую роль, как хранители и переносчики туляремийной инфекции, играют иксодовые клещи. Грызуны выделяют возбудителя с испражнениями, мочой и загрязняют воду открытых водоемов и колодцев, продукты литания, зерно, сено, солому, фураж. В организм человека возбудитель туляремии проникает через повреждённую кожу и слизистые оболочки глаз, пищеварительный и дыхательный тракт.

Пути заражения людей:

– через укусы клещей, слепней, комаров вблизи водоемов, в речных поймах во время охоты, покоса и др.;

– при вдыхании инфицированной пыли при работе с сеном, соломой, зерном, фуражом, овощами, уборке помещений, заселенных больными туляремией грызунами и др.;

– водный – при употреблении для питья воды из случайных водоемов, купания  в инфицированном водоеме или умывания из него;

– контактный — через кожу и слизистые оболочки, реализуется при отлове больных грызунов, снятии шкурок, разделке тушек зайцев, занесении инфекции грязными руками на слизистые глаза, уколе инфицированной соломой и др.;

– пищевой — при употреблении инфицированных продуктов питания, непроверенного мяса зайца и др.

Основные признаки заболевания: от момента заражения до появления первых признаков заболевания чаще всего проходит от 3 – 7 дней до 2- 3 недель. Болезнь начинается остро с повышения температуры до 38°С – 40°С, озноба, сильной головной боли, слабости, мышечных болей (чаще в поясничной области и икроножных мышцах). На 2-3 день увеличиваются лимфатические узлы вблизи того места, где микробы проникли в организм (в области шеи, ушей, подмышечной впадины, в паху, или в других местах). Часто наблюдаются односторонние ангины, заболевания глаз, в зимний период затяжные пневмонии. Заболевание обычно продолжается 2 — 3 недели (иногда дольше), в редких случаях может рецидивировать. Переболевшие туляремией сохраняют невосприимчивость к этому заболеванию на многие годы.

Меры профилактики:

1. Самая эффективная мера — это проведение профилактических прививок против туляремии. Прививка безболезненна, проводят ее во всех поликлиниках методом нанесения царапины в области плеча, защищает от болезни в течение 5 лет. Прививки против туляремии проводятся населению, проживающему в зоне природных очагов или лицам из групп риска, связанных с профессиональным риском заражения.

2. Кроме прививок должны проводиться следующие мероприятия:

–  защита от грызунов колодцев, родников, пищевых продуктов;

– исключать употребление для питья сырой воды из случайных водоисточников;

–     борьба с грызунами на предприятиях, в жилых помещениях и хозяйственных постройках, на садово-огородных участках (использование капканов, отравленных приманок), обеспечение недоступности для грызунов жилых, складских, производственных помещений, дач, погребов, гаражей и

др. построек;

–     уничтожение зарослей бурьяна возле жилых зданий и в населённых пунктах;

–   не создавать самопроизвольные свалки на территории садово-огородных кооперативов, вокруг населённых пунктов.

–  использование реппелентов (средств защиты от укусов комаров, слепней, присасывания клещей) во время рыбной ловли, отдыха на природе, особенно в поймах рек.

% PDF-1.6
%
373 0 объект
> / Names 18901 0 R / ViewerPreferences> / Metadata 502 0 R / Pages 341 0 R / StructTreeRoot 12625 0 R / Type / Catalog / Lang (EN) / PageLabels 339 0 R >>
endobj
18901 0 объект
>
endobj
502 0 объект
> поток
Библиотека Adobe PDF 7.0False2007-11-09T11: 14 + 13: 002008-09-12T14: 38: 20-06: 002008-09-12T14: 38: 20-06: 00Adobe InDesign CS2 (4.0.5)

uuid: 87e140ad-96bf-4341-8547-f24a4a8e3fd1proof: pdfadobe: docid: indd: ba760762-ee64-11db-9dea-8437dba0d5bc

application / pdf22494NCCL082-31-37060NCCL-86101036098NCCL041-101-74004NCCL-124-80031109NCCL-69059-22-124NCCL050083085107NCCL124107-45033NCCL033029102-26

конечный поток
endobj
341 0 объект
>
endobj
12625 0 объект
>
endobj
339 0 объект
>
endobj
340 0 объект
>
endobj
487 0 объект
>
endobj
488 0 объект
>
endobj
18902 0 объект
>
endobj
489 0 объект
> / Pa0 490 0 R / CM59> / Pa3 491 0 R / CM60> / CM61> / CM62> / CM63> / CM64> / CM65> / CM66> / CM67> / CM68> / CM69> / CM70> / CM10> / CM71> / CM72> / CM11> / CM12> / CM73> / CM13> / CM74> / CM75> / CM14> / CM76> / CM15> / CM16> / CM17> / CM18> / CM19> / CM80> / CM81 > / CM20> / CM21> / CM83> / CM22> / CM84> / CM23> / CM24> / CM85> / CM25> / CM86> / CM26> / CM27> / CM88> / CM28> / CM89> / CM29> / CM30> / CM31> / CM32> / CM33> / CM34> / CM35> / CM36> / CM37> / CM38> / CM39> / CM1> / A1 492 0 R / CM2> / A2 493 0 R / CM3> / CM4 > / CM5> / CM6> / CM7> / CM8> / CM9> / CM40> / CM41> / CM42> / CM43> / CM44> / CM45> / CM46> / CM47> / CM48> / CM49> / CM50> / CM51> / CM52> / CM53> / CM54> / CM55> / CM56> / CM57 >>>
endobj
490 0 объект
>
endobj
491 0 объект
>
endobj
492 0 объект
>
endobj
493 0 объект
>
endobj
19031 0 объект
>
endobj
19032 0 объект
>
endobj
19071 0 объект
>
endobj
19073 0 объект
>
endobj
19093 0 объект
>
endobj
19094 0 объект
>
endobj
19107 0 объект
>
endobj
19109 0 объект
>
endobj
19121 0 объект
>
endobj
19129 0 объект
>
endobj
19133 0 объект
>
endobj
19134 0 объект
>
endobj
19170 0 объект
>
endobj
19171 0 объект
>
endobj
18927 0 объект
>
endobj
18929 0 объект
>
endobj
18941 0 объект
>
endobj
18945 0 объект
>
endobj
18947 0 объект
>
endobj
18949 0 объект
>
endobj
18951 0 объект
>
endobj
18955 0 объект
>
endobj
18997 0 объект
>
endobj
19119 0 объект
>
endobj
19120 0 объект
>
endobj
18965 0 объект
>
endobj
18999 0 объект
>
endobj
19081 0 объект
>
endobj
19111 0 объект
>
endobj
19112 0 объект
>
endobj
18953 0 объект
>
endobj
19015 0 объект
>
endobj
19017 0 объект
>
endobj
19019 0 объект
>
endobj
19021 0 объект
>
endobj
19022 0 объект
>
endobj
19049 0 объект
>
endobj
19051 0 объект
>
endobj
19053 0 объект
>
endobj
19055 0 объект
>
endobj
19057 0 объект
>
endobj
19059 0 объект
>
endobj
19063 0 объект
>
endobj
19065 0 объект
>
endobj
19067 0 объект
>
endobj
19069 0 объект
>
endobj
19075 0 объект
>
endobj
19087 0 объект
>
endobj
19088 0 объект
>
endobj
18933 0 объект
>
endobj
18943 0 объект
>
endobj
19013 0 объект
>
endobj
19077 0 объект
>
endobj
19078 0 объект
>
endobj
18916 0 объект
>
endobj
18907 0 объект
>
endobj
18908 0 объект
>
endobj
18913 0 объект
>
endobj
18935 0 объект
>
endobj
19079 0 объект
>
endobj
19080 0 объект
>
endobj
19062 0 объект
>
endobj
13168 0 объект
>
endobj
13173 0 объект
>
endobj
13178 0 объект
>
endobj
13183 0 объект
>
endobj
13188 0 объект
>
endobj
13193 0 объект
>
endobj
13198 0 объект
>
endobj
13203 0 объект
>
endobj
13208 0 объект
>
endobj
13217 0 объект
>
endobj
13222 0 объект
>
endobj
13227 0 объект
>
endobj
13232 0 объект
>
endobj
13237 0 объект
>
endobj
13242 0 объект
>
endobj
13247 0 объект
>
endobj
13288 0 объект
>
endobj
13293 0 объект
>
endobj
13299 0 объект
>
endobj
13305 0 объект
>
endobj
13353 0 объект
>
endobj
13357 0 объект
>
endobj
13362 0 объект
>
endobj
13367 0 объект
>
endobj
14444 0 объект
>
endobj
14667 0 объект
>
endobj
12858 0 объект
>
endobj
14948 0 объект
>
endobj
15107 0 объект
>
endobj
15257 0 объект
>
endobj
15322 0 объект
>
endobj
15512 0 объект
>
endobj
18197 0 объект
>
endobj
15550 0 объект
>
endobj
18205 0 объект
>
endobj
15647 0 объект
>
endobj
13137 0 объект
>
endobj
13214 0 объект
>
endobj
13287 0 объект
>
endobj
13352 0 объект
>
endobj
2509 0 объект
>
endobj
18081 0 объект
>
endobj
18082 0 объект
>
endobj
18083 0 объект
>
endobj
13428 0 объект
>
endobj
13351 0 объект
>
endobj
13372 0 объект
>
endobj
13373 0 объект
>
endobj
13375 0 объект
>
endobj
13376 0 объект
>
endobj
13377 0 объект
>
endobj
13378 0 объект
>
endobj
13379 0 объект
>
endobj
13380 0 объект
>
endobj
13381 0 объект
>
endobj
13382 0 объект
>
endobj
13384 0 объект
>
endobj
13385 0 объект
>
endobj
13386 0 объект
>
endobj
13387 0 объект
>
endobj
13388 0 объект
>
endobj
13389 0 объект
>
endobj
13390 0 объект
>
endobj
13391 0 объект
>
endobj
13392 0 объект
>
endobj
13393 0 объект
>
endobj
13394 0 объект
>
endobj
13395 0 объект
>
endobj
13396 0 объект
>
endobj
13397 0 объект
>
endobj
13398 0 объект
>
endobj
13399 0 объект
>
endobj
13400 0 объект
>
endobj
13401 0 объект
>
endobj
13402 0 объект
>
endobj
13403 0 объект
>
endobj
13404 0 объект
>
endobj
13405 0 объект
>
endobj
13406 0 объект
>
endobj
13407 0 объект
>
endobj
13408 0 объект
>
endobj
13409 0 объект
>
endobj
13410 0 объект
>
endobj
13411 0 объект
>
endobj
13413 0 объект
>
endobj
13414 0 объект
>
endobj
13415 0 объект
>
endobj
13416 0 объект
>
endobj
13417 0 объект
>
endobj
13418 0 объект
>
endobj
13419 0 объект
>
endobj
13420 0 объект
>
endobj
13421 0 объект
>
endobj
13422 0 объект
>
endobj
13423 0 объект
>
endobj
13424 0 объект
>
endobj
13425 0 объект
>
endobj
13426 0 объект
>
endobj
13427 0 объект
>
endobj
12337 0 объект
>
endobj
87 0 объект
> / Font> / ProcSet [/ PDF / Text] / ExtGState >>> / Type / Page >>
endobj
350 0 объект
>
endobj
19354 0 объект
> поток
HWYo7 ~ ׯ cw> -a9jy
c «K» ɉSU $ sI
Z0ͣXE ~ LJk 鷋 6y; vM =; bd106? 6} K0l \ yǂ

мМ ^ sBdkw {6M3LG`zZ4cJqiaӭ 4VM? Ni] `/ PłzPsa
п
#cNKs
K @ 7pPB`-gg «‘i’

.

Туляремия (кроличья лихорадка) | Общественное здравоохранение и медицинская энтомология | Purdue | Биология | Энтомология | Насекомые | Клещи | Заболевания | Мониторинг | Контроль | Горячие темы | Сельское хозяйство

Туляремия (также известная как «кроличья лихорадка» и «лихорадка оленьих мух») — это заболевание, которое впервые было признано чумным заболеванием грызунов в 1911 году в Туларе, штат Калифорния. Это вызвано очень заразной бактерией, которая широко распространена «в природе», встречается у различных диких животных, в воде и даже в почве.Бактерия не зависит от передачи членистоногими, но может передаваться клещами и оленьими мухами. Ежегодно диагностируется около 200 случаев заболевания людей, летальность среди нелеченных пациентов составляет 5-7%. Начальные симптомы инфекции различаются в зависимости от способа прививки.

• Бактерия с научным названием Francisella tularensis.

• По всему миру, но в основном в северном полушарии, включая Азию и Северную Америку.
• Большинство случаев заболевания происходит на юге центральной части США, особенно на плато Озарк в штате Миссури.

• Общие симптомы включают жар, головную боль, озноб, тошноту и сухой кашель.
• Язвенное поражение на месте инокуляции бактерий примерно у 80% пациентов, в том числе при укусе клеща или, после другого контакта с F. tularensis , в порезе на пальце или во рту.
• Может включать увеличенные регионарные лимфатические узлы, потенциально может перерасти в пневмонию и может быть смертельным.

• Различные дикие животные, особенно кролики, зайцы и грызуны.
• ПРИМЕЧАНИЕ: эта бактерия также встречается в воде и почве.

• Amblyomma americanum , клещ одинокая звезда.
• ПРИМЕЧАНИЕ: вид оленьей мухи является переносчиком в западной части США.S., но передача оленьими мухами не была зарегистрирована в восточной части США

.

• Большинство инфекций передается, когда охотники обращаются с инфицированными мелкими млекопитающими, особенно с кроликами.
• Некоторые инфекции при проглатывании недоваренного мяса инфицированных мелких млекопитающих, особенно кроликов.
• Некоторые инфекции при контакте с инфицированными водными млекопитающими, такими как ондатра.
• Некоторые инфекции при проглатывании воды, зараженной бактериями.
• Через укусы инфицированных инфицированных клещей на юге центральной части США и оленьих мух на западе США
• ПРИМЕЧАНИЕ. Передача от человека к человеку неизвестна.

• Небольшое изъязвление на месте проникновения бактерий (см. Выше «Симптомы инфекции»).
• Поражение обычно имеет розоватую ямку в центре и приподнятый гребневидный волдырь по периметру.
• Общие симптомы вместе с историей активности в местах обитания, где встречается туляремия.
• Подтверждение основано на лабораторном анализе крови или кровавой мокроты.

• Антибиотик, назначенный врачом.

• Вакцины для широкой публики нет, но есть вакцина для людей, работающих в группах повышенного риска.
• Избегайте места обитания клещей и контакта с зараженной растительностью (см. E-243-W «Биология и медицинское значение клещей в Индиане» (PDF 757KB)).
• Носите одежду, состоящую из рубашки с длинными рукавами, длинных штанов и ботинок.
• Используйте репеллент, рекомендованный CDC, и обработайте одежду перметрином.
• Обращайтесь с промысловыми животными, такими как кролики, осторожно, особенно при снятии шкуры и одевании.

.

границ | Популяционная геномика Francisella tularensis subsp. holarctica и ее влияние на экоэпидемиологию туляремии в Швейцарии

Введение

Классификация организмов в соответствии с присущими им характеристиками генома стала незаменимым принципом в молекулярной биологии. За прошедшие годы прогресс в технологиях секвенирования привел к резкому увеличению количества доступных данных секвенирования и постоянно растущему таксономическому разрешению. Это развитие привело к появлению массовых методов параллельного секвенирования, которые позволяют классифицировать и характеризовать организм в масштабе всего генома, открывая новые перспективы в молекулярной криминалистике, экологии и эпидемиологии.Преимущества классификации на основе полногеномного секвенирования (WGS) наиболее очевидны при применении к генетически мономорфным организмам, например Mycobacterium tuberculosis (Lee et al., 2015; Stucki et al., 2016), Bacillus anthracis (Girault et al., 2014) и Francisella tularensis (Dwibedi et al., 2016).

Туляремия вызывается грамотрицательной факультативной внутриклеточной бактерией F. tularensis . Из-за очень низкой инфекционной дозы и высокой смертности при вдыхании в виде аэрозоля, этот организм занесен в список биологически опасных агентов категории А (Rotz et al., 2002). Два подвида несут ответственность за большинство случаев туляремии. F. tularensis subsp. tularensis ( Ftt ) и F. tularensis subsp. holarctica ( пятый ). В Европе встречается менее вирулентный Fth , который обычно вызывает спорадические случаи, первые из которых были задокументированы в 1930-х годах (Jusatz, 1961). Fth , однако, встречается во всем северном полушарии. С конца 1990-х годов число случаев заболевания увеличивается, и вспышки, превышающие 1000 случаев, были зарегистрированы в Чешской Республике, Венгрии, Испании (Pérez-Castrillón et al., 2001), Швеции и Финляндии (Маурин, Гюранец, 2016). Считается, что в США большинство из инфекций F. tularensis происходит от укусов клещей (Petersen et al., 2009), тогда как в Европе ситуация менее ясна. В Скандинавии Fth передается преимущественно комарами, и считается, что патоген сохраняется в водном жизненном цикле с комарами, личинками комаров и грызунами (Desvars et al., 2015). Наземный жизненный цикл с членистоногими в качестве резервуаров и небольшими наземными грызунами и зайцеобразными в качестве восприимчивых хозяев является преобладающим в большинстве европейских стран, включая Швейцарию.В этих странах прямой контакт с инфицированными грызунами и зайцеобразными, по-видимому, является основным путем заражения. Что касается передачи членистоногими переносчиками, то оценочный процент случаев туляремии, вызванной укусами клещей, колеблется от 12% (Словакия) до 26% (Франция) (Maurin and Gyuranecz, 2016). Поскольку туляремия является заболеванием, подлежащим регистрации в Швейцарии, эпидемиологические данные собираются из отчетов пациентов, отправляемых в органы здравоохранения из пункта первичной медицинской помощи. Согласно этой информации, укусы клещей могут быть причиной 47% случаев туляремии, зарегистрированных за последние 10 лет.Однако качество анкетных данных часто ограничено. Кроме того, отсутствует подтверждение причинной связи между укусами членистоногих и случаями туляремии с использованием метода, обеспечивающего адекватную дискриминационную способность. В этом исследовании эпидемиология, пути передачи и филогеографические свойства туляремии в Швейцарии очерчены на основе 59 секвенированных геномов Fth , выделенных от людей, животных и клещей (Таблица 1).

Таблица 1 .Обзор 59 полногеномных секвенированных штаммов Fth из Швейцарии, использованных в этом исследовании.

Материалы и методы

Сбор клещей

В период с 2009 по 2015 год в 165 местах сбора по всей Швейцарии было собрано 120 000 квестовых клещей с помощью маркировки низкой растительности. Клещи были случайным образом идентифицированы на основе морфологических характеристик (Keirans, 1997) и сразу же хранили при -80 ° C. Впоследствии клещей промывали один раз в 75% этаноле и дважды в деионизированной воде, сушили на бумажных полотенцах и рассортировывали по группам из 10 нимф или 5 взрослых самцов или самок I.ricinus клещей. Объединенные образцы хранили при -80 ° C до дальнейшей обработки (Gäumann et al., 2010).

Гомогенизация клещей

Гомогенаты клещей получали из пулов замороженных клещей, состоящих из 10 нимф или 5 взрослых самок или самцов клещей, следующим образом: 600 мкл холодного PBS добавляли к каждому пулу замороженных клещей. Образцы немедленно гомогенизировали с использованием системы TissueLyser (Qiagen). Вкратце, в каждую пробирку (микропробирки для сбора; Qiagen) добавляли по одной 3-мм шарике из карбида вольфрама (Qiagen), и пулы клещей гомогенизировали в течение 4 минут при 30 Гц.После центрифугирования образцов в течение 5 с при 3220 g супернатанты собирали и разделяли для дальнейшего использования: одну аликвоту 200 мкл использовали для экстракции ДНК, а четыре аликвоты по 150 мкл немедленно замораживали в жидком азоте и хранили при -80 ° C. Для повышения успешности последующих попыток культивирования 40 мкл глицерина (100%) добавляли в качестве криопротектора к двум аликвотам.

Скрининг гомогенатов клещей на наличие пятого

ДНК

была автоматически извлечена с использованием протокола на основе магнитных шариков (QiaSymphony, QIAGEN).В общей сложности 16000 пулов клещей были проверены на наличие Fth с использованием одностадийного анализа RT-PCR в реальном времени на основе маркера VNTR Ft-M19 (Byström et al., 2005). Положительные образцы Ft-M19 ПЦР были подтверждены внутренним анализом ОТ-ПЦР в реальном времени, нацеленным на ген fopA (таблица 2).

Таблица 2 . ПЦР-анализы, нацеленные на белок А внешней мембраны Francisella , используемый для F. tularensis ssp. скрининг.

Выделение Fth из гомогенизированных образцов клещей

Выращивали

аликвот положительных образцов ПЦР.Вкратце, замороженные аликвоты быстро размораживали и 50 мкл каждой инокулировали в 10 мл бульонной среды T (Becker et al., 2016), а также наносили штрихами на шоколадный агар PolyViteX (BioMérieux) и селективный агар Thayer Martin VCNT Neisseria (Oxoid). Планшеты и жидкие культуры инкубировали при 37 ° C с использованием GENBox C02 (BioMérieux) в течение 2–6 дней. Предполагаемые культуры Fth подтверждали ПЦР в реальном времени, как описано выше (fopA; таблица 2).

Выделение ДНК для WGS

Все манипуляции с живыми культурами проводились в лаборатории содержания BSL 3 (номер разрешения: A110502 / 3).Изоляты Fth выращивали на шоколадном агаре PolyViteX (BioMérieux) в течение 2 дней, собирали колонии и суспендировали в 500 мкл буфера AVL (Qiagen). Лизаты инактивировали нагреванием в течение 15 минут при 100 ° C, а затем ДНК экстрагировали с использованием EZ1 или EZ1 Advanced robot (Qiagen) в соответствии с инструкциями производителя (EZ1, Tissue Kit, Bacteria Card, Qiagen).

Образцы человека

Выполняя функции швейцарского национального справочного центра по туляремии у людей, лаборатория Spiez поддерживает коллекцию культур изолятов Fth , полученных в результате рутинной клинической диагностики.Пациенты и эпидемиологические данные собираются Федеральным управлением общественного здравоохранения в соответствии с Законом об эпидемиях и постановлением (SR 818.101.126).

Образцы животных

Штаммы, выделенные от животных, были отобраны из коллекции штаммов Института ветеринарной бактериологии, Ветсуисс, Берн, Швейцария, который является национальным справочным центром по туляремии у животных.

Секвенирование всего генома

59 изолятов Fth секвенировали на платформе Illumina HiSeq 2500 с использованием химии парных концов TruSeq для подготовки библиотеки.Средняя длина считывания составляла 126 пар оснований, а средний размер вставки составлял 350 пар оснований (стандартное отклонение = 87,593, нижний квантиль = 272, верхний квантиль = 488). Перед сборкой ~ 50 000 000 считываний секвенирования были обрезаны по качеству с помощью Trimmomatic V0.32 (Bolger et al., 2014).

Качественные обрезанные чтения были собраны с использованием SPAdes -3.10.1 (Bankevich et al., 2012), что дало ~ 100 контигов со средним значением N50 27000 п.н. Охват геномов Fth был> 1000 раз во всех выборках.Чтобы использовать конвейер пангенома Roary (Page et al., 2015), файлы аннотаций gff3 были созданы с помощью Prokka (Seemann, 2014) с использованием франко-иберийского штамма Fth FTNF002-00 (NC_009749) в качестве эталона. Основываясь на этих файлах gff3, ядерный и пан-геномы были выведены с использованием Roary с применением порога идентичности 95% blastp . Данный ген должен присутствовать в 100% образцов, чтобы быть включенным в основной геном. Mafft (Katoh et al., 2002) был использован для выравнивания ядра генома. Неоднозначно выровненные регионы и индели были удалены из выравнивания Mafft с помощью Gblocks (Castresana, 2000) и SEQfire (Ajawatanawong et al., 2012). Филогенез с максимальной вероятностью был выведен с помощью PhyML (исходное дерево: BioNJ; поиск топологии дерева: NNI; модель нуклеотидного замещения: TN93; количество повторений Bootstrap: 1000) (Guindon et al., 2010). Мутации в секвенированных штаммах относительно эталонных геномов были идентифицированы с помощью breseq (Deatherage and Barrick, 2014).

Для отнесения секвенированных штаммов к установленной номенклатуре узлов canSNP использовалось программное обеспечение canSNPer (Lärkeryd et al., 2014). Именование новых подтипов, обнаруженных в этом исследовании, согласуется со схемой номенклатуры canSNP, в которой каждому вновь идентифицированному SNP присваивается возрастающий порядковый номер. Чтобы реализовать новые подтипы в инструменте canSNPer, текстовые файлы, содержащие позиции SNP и топологию дерева, были соответствующим образом скорректированы.

Расчет средней идентичности нуклеотидов с использованием стандартного алгоритма MUMmer (ANIm) для всего генома был выполнен с использованием программы python pyani (v0.2.4). Иерархический кластерный анализ корреляционной матрицы ANI был выполнен с использованием пакета hclust (R v3.4.3).

Пространственная статистика

Филогеографическая интерполяция выполнялась с помощью пакета R Phylin (Tarroso et al., 2015). Расчет пространственных кластеров болезней проводился (проводился) с помощью пакета R DCluster (Hornik et al., 2003).

Результаты

Распространенность Fth в швейцарских клещах

Всего было проанализировано 120 000 квестовых клещей, и только 25 гомогенатов клещей дали положительный результат на Fth с помощью ПЦР.Это соответствует распространенности ~ 0,02%.

Четырнадцать изолятов Fth были успешно выделены из 25 положительных гомогенатов клещей. Извлечение из образцов, консервированных глицерином, было немного улучшено, и изоляция часто была легче из агара Neisseria, чем из шоколадного агара из-за уменьшения контаминационной флоры.

Филогенетический контекст изолятов Swiss Fth

ANIm — это стандартный метод in silico для определения границ бактериальных видов с пороговым значением 94–96%.Здесь ANIm был применен для подтверждения принадлежности 59 изолятов к F. tularensis subsp . holarctica . Полные геномы сравнивали с типовыми штаммами: F. tularensis subsp . tularensis NIH B-38, F. tularensis subsp. holarctica FTNF002-00, F. tularensis subsp . mediasiatica FSC147 и F. tularensis subsp. novicida U112. В этом небольшом наборе данных мы обнаружили, что порог ANIm, равный 99.5% смогли выделить подвиды F. tularensis . Все 59 изолятов показали> 99,9% идентичности ANI с F. tularensis subsp . holarctica FTNF002-00 и F. tularensis subsp . holarctica FSC200.

Чтобы поместить полногеномные последовательности 59 Swiss Fth в глобальный филогенетический контекст, мы использовали подход канонического SNP (canSNP) (Lärkeryd et al., 2014). Согласно этому методу типирования 54 штамма (91,5%) были отнесены к B.11 клады, которая преобладает в Западной Европе, включая Швейцарию (Pilo et al., 2009; Vogler et al., 2009; Dwibedi et al., 2016). Три изолята животных и два изолята человека (11%) принадлежат к кладе B.12 Северо-Восточной Европы (рис. 1).

Рисунок 1 . Обзор текущей схемы типирования canSNP. Зеленые пятна указывают на типы canSNP, обнаруженные в 59 секвенированных изолятах Swiss Fth .

Для увеличения филогенетического разрешения был применен анализ SNP ядра генома, основанный на выравнивании 1477202 п.н., и был выявлен аналогичный паттерн ветвления B.11 clade, как описано в европейском обзоре Dwibedi et al. (2016). Клад B.45 был представлен 44 изолятами (18 человек, 14 клещей, 12 животных), а B.46 — четырьмя изолятами (три человека, 1 животное). Кроме того, шесть изолятов (2 человека, 4 животных) были отнесены к кладе, которая ранее была представлена ​​только одним швейцарским изолятом. Этот новый субклад B.11 отличается 5 SNP (B.82 / B.83 / B.84 / B.85 / B.86; Рисунок 2).

Рисунок 2 . Филогенетические отношения на основе выравнивания ядра генома 59 секвенированных штаммов Fth .Клады и субклады маркируются в соответствии с номенклатурой canSNP. Конечные буквы на этикетках наконечников указывают на источник изолятов (H, человек; A, животное; T, клещ).

За исключением клад B.48 и B.52, обнаруженных исключительно в Испании, а также французской клады B.54, все субклады, полученные из B.45, были представлены среди 59 секвенированных изолятов. Кроме того, можно выделить пять новых субкладов, производных от B.45 (B.87 / B.88, B.89, B.90, B.91, B.92; рисунок 2).

Пространственная зависимость генетической изменчивости среди изолятов представлена ​​полувариограммой, показанной на рисунке 3.Хорошее соответствие ( R ² = 0,96) применяемой сферической модели ясно указывает на статистически значимую зависимость между генетической изменчивостью и географическим расстоянием. Интерполяция Кригинга (Krige, 1951), основанная на модели, полученной из полувариограммы, показывает, что клады B.45 распространены на большей части территории Швейцарии на высоте ниже 1500 м над уровнем моря. Подклады B.45, которые показывают более высокую пространственную когерентность, видны как центральные горячие точки (рисунок 4). Клады B.46 и B.86 показывают географически более сфокусированное распределение (рис. 5). Три изолята животных и один человек, отнесенные к кладе B.12 Северо-Восточной Европы, происходили из районов, близких к северной и восточной границе Швейцарии. Один изолят человека был изолирован в центральной Швейцарии.

Рисунок 3 . Вариограмма, показывающая пространственную зависимость генетического сходства между двумя штаммами как функцию расстояния. Размер кружков пропорционален количеству деформаций, используемых для расчета дисперсии.Красная линия указывает соответствие сферической модели, используемой для описания пространственной структуры.

Рисунок 4 . Пространственная интерполяция филогенетических кластеров по кригину. Из-за высокого генетического разнообразия Fth географическое распределение штаммов показано на двух отдельных картах. На этом рисунке показано интерполированное распределение субкладов B.45. На рисунке 5 представлены данные для субкладов B.33, B.86 и B.46.

Рисунок 5 .То же, что и на рис. 4.

Генетическая изменчивость в швейцарской пятой популяции

Анализ Breseq выявил 259 полиморфизмов в 59 секвенированных геномах Fth относительно генома FTNF002-00. Мы идентифицировали 36 делеций, 28 вставок и 195 SNP. Семьдесят девять SNP не были синонимами. Из 116 синонимичных SNP 46 были расположены в кодирующих областях генома. Что касается мутаций, которые были обнаружены исключительно в недавно определенном субкладе B.86, 9 из 17 SNP не были синонимичными.Две несинонимичные мутации были обнаружены в генах, связанных с биосинтезом гема ( hemA ) и цитохрома с ( FTA_0224 ). Одна мутация изменяет члена ( FTA_0090 ) суперсемейства главных посредников (MFS), которое участвует в транспорте субстратов малых молекул во всех классах организмов и играет важную роль в поддержании осмотического баланса между цитозолем и окружающей средой. Остальные 5 несинонимичных SNP обнаружены в генах, кодирующих белки, участвующие в углеводном ( FTA_0510, FTA_1026, FTA_1126) и жирнокислотном ( FTA_0617 ) метаболизме Fth (Таблица 3).

Таблица 3 . Список несинонимичных SNP, идентифицированных с конвейером breseq .

Все пять штаммов, отнесенных к кладе B.12, показали SNP в гене rrl (23S рРНК) (A2059C и A453G), которые, как было установлено, ответственны за устойчивость к эритромицину, характерную для этой клады (Karlsson et al. ., 2016). Эти результаты согласуются с результатами тестирования чувствительности к антибиотикам и типирования MLVA Origgi et al.выполнено на тех же изолятах (Origgi et al., 2014).

Все генетические вариации, обнаруженные при выравнивании основного генома со штаммом FTNF00-002 в качестве ссылки, включены в файл вызова вариантов (vcf) в качестве дополнительного материала (дополнительная таблица 1).

Эпидемиология туляремии в Швейцарии

С 2004 года заболеваемость туляремией в Швейцарии выросла примерно в 15 раз с 0,04 до 0,69 на 100 000 в год (Рисунок 6). За исключением пациентов старше 75 лет, мужчины чаще страдали от туляремии.Мы наблюдаем бимодальное распределение числа случаев по возрастной группе с узким пиком между 10 и 12 годами и более широким пиком, охватывающим возраст от 27 до 75 лет (рис. 7).

Рисунок 6 . Увеличение абсолютного числа случаев и заболеваемости туляремией в Швейцарии с 2004 по 2016 год.

Рисунок 7 . Бимодальное возрастное распределение больных туляремией. Мужчины более подвержены заболеванию, чем женщины.

В соответствии с наземным жизненным циклом, изоляты Fth от людей, животных и клещей представлены в одних и тех же конечных субкладах.В субкладе B.51 изоляты FT40 / FT47, полученные из клещей, не обнаруживают различий в выравнивании ядра генома на 1 474 944 оснований с изолятом FT75 человека. То же самое относится к изолятам FT05 (человек) и FT58 (животное) в кладе B.90.

Большинство из 276 пациентов сообщили об укусах насекомых или членистоногих до появления симптомов туляремии (33% укусов клещей, 24% насекомых — всего 57%). Контакт с дикими животными считался причиной 22% инфекций. В 23% случаев источник был неизвестен.Доля случаев с подозрением на трансмиссивную инфекцию туляремии коррелировала с клиническими проявлениями заболевания. Железисто-язвенный тип, обычно связанный с укусом кроветворных членистоногих, наблюдался в 60% случаев. Легочный тип был представлен у 24%, а абдоминальный / ротоглоточный тип — у 14% пациентов (рис. 8). Таким образом, 38% из 276 зарегистрированных инфекций могут быть связаны с прямым или косвенным контактом с инфицированными дикими животными.

Рисунок 8 . Классификация туляремии в Швейцарии с 2004 по 2016 год в соответствии с клиническими проявлениями.

Оценка риска с поправкой на популяцию для пространственного распределения случаев туляремии показывает неравномерное распределение. Районы с повышенным относительным риском преимущественно расположены в северо-восточной части Швейцарии (Рисунок 9). Наши данные показывают, что клещи являются основным источником инфекции в Швейцарии. Таким образом, мы сопоставили оценки риска с климатическими, а также экологическими факторами, которые, как известно, влияют на выживаемость и переносимость клещей.Относительная влажность (RH) и дефицит насыщения (SD), как известно, имеют решающее значение для численности и выживания клещей. Следовательно, мы сравнили нормализованные к поверхности средние уровни заболачивания в районах с повышенным риском заражения туляремией и в районах с низким риском и обнаружили весьма значимое влияние влажности почвы (рисунки 10, 11).

Рисунок 9 . Пространственное распределение случаев по регионам почтовых индексов (первые две цифры). Показан расчетный относительный риск, который определяется отношением наблюдаемых случаев к ожидаемым.В большинстве областей случаев меньше, чем ожидалось, например, относительный риск ниже 1 (пустая зона). Остальные области закрашены от оранжевого до красного в соответствии со значением относительного риска.

Рисунок 10 . Географический обзор водонасыщенности почвы (заболачивания). В целом, почвы в северо-восточной части Швейцарии демонстрируют более высокую степень водонасыщения по сравнению с другими регионами.

Рисунок 11 . В регионах с повышенным относительным риском туляремии степень заболачивания значительно выше, чем в регионах с низким риском ( p = 1.2 * 10 ⁻¹⁵ ).

Уменьшение биоразнообразия из-за урбанизации влияет на компетентность переносчиков, изменяя соотношение компетентных и некомпетентных хозяев. Большинство областей с повышенным риском заражения туляремией сильно фрагментированы и имеют размер ячеек ниже среднего (Рисунок 12).

Рисунок 12 . Географический обзор степени фрагментации ландшафта швейцарских кантонов. Большинство регионов с высоким риском заражения туляремией также сильно фрагментированы.

Обсуждение

Распространенность, генетическое разнообразие и популяционная геномика швейцарских пятых изолятов

Установленная распространенность 0,2 ‰ является низкой по сравнению с другими патогенами, обнаруженными у клещей (Oechslin et al., 2017), и в основном подтверждает предыдущее меньшее обследование швейцарской армии (Wicki et al., 2000).

Успешное культивирование Fth из клещей подтверждает роль I. ricinus как важного переносчика патогена. Кроме того, наличие изолятов было предпосылкой для предполагаемой WGS филогении с высоким разрешением.

Как описано в другом месте (Origgi et al., 2014), штаммы B.13 и B.11 совместно циркулируют в Швейцарии с преобладанием последнего. Поразительно, но географическое происхождение четырех из пяти изолятов B.13 близко к северной и восточной границе Швейцарии. Поскольку штаммы B.11 и B.13 одинаково установлены в популяции немецких зайцев (Müller et al., 2013), а B.13 преобладает в Австрии (Tomaso et al., 2005), наши данные предполагают спорадическое вторжение B.13 штамм из соседних стран.

В соответствии с недавними публикациями о расселении Fth в Европе (Dwibedi et al., 2016), Швейцария, по-видимому, обладает исключительно высоким генетическим разнообразием патогена по сравнению с другими европейскими странами. Филогенетическая структура и пропорция субкладов B.11, полученных из швейцарских изолятов, почти идентичны таковой в европейском исследовании. В этом аспекте Швейцарию можно рассматривать как мелкомасштабную модель для структуры населения Fth .Более того, идентификация шести дополнительных субкладов B.11 подчеркивает представление о том, что в альпийском регионе существует эволюционно более старая и очень разнообразная популяция основателей (Dwibedi et al., 2016).

Основным фактором, который положительно связан с биоразнообразием экосистемы, является топографическая сложность среды обитания (Zhou et al., 2015). Известно, что вместе с факторами, связанными с климатом, топография влияет на широкий спектр параметров окружающей среды, включая гидрологию, дисперсию питательных веществ, структуру почвы и микроклимат.Кроме того, горные хребты в масштабе Швейцарских Альп создают существенный барьер для миграции животных. В этом свете наблюдаемое разнообразие клады B.11 в Швейцарии и статистически значимая корреляция между генетическим и географическим расстоянием может отражать мелкомасштабную топографическую фрагментацию среды обитания восприимчивых хозяев и переносчиков патогенов.

Анализ недавно идентифицированного субклада В.11

В соответствии с европейскими исследованиями субклад B.45 B.11 оказался наиболее успешным субкладом в Швейцарии с точки зрения географического распределения и распространенности. Примечательно, что все 14 изолятов клещей из пяти различных географических регионов были отнесены к кладе B.45, тогда как B.46 и B.86 были включены исключительно изолятами человека и животных. Одно из возможных объяснений этого наблюдения может заключаться в том, что штаммы субклада B.45 лучше адаптированы к переносчику членистоногих и, таким образом, повышают переносимость переносчика клещей по сравнению с клещами, несущими B.46 / B.86. Подсказку для этой аргументации дают наши данные breseq . Семь несинонимичных SNP были обнаружены исключительно в субкладе B.86 B.11, которые могут модулировать функцию белков, участвующих в внутриклеточном выживании. Члены MFS участвуют в транспорте низкомолекулярных субстратов через все классы организмов и играют важную роль в поддержании осмотического баланса между цитозолем и окружающей средой. В F. tularensis фагосомные транспортные белки, которые являются подсемейством MFS, были идентифицированы как факторы, необходимые для летальности для взрослых плодовых мух (Akimana and Kwaik, 2011).Кроме того, члены класса MFS обсуждаются как мишень для ослабления и разработки вакцины (Marohn et al., 2012). Устойчивость к окислительному стрессу и приобретение железа являются фундаментальными аспектами выживания патогена в среде хозяина. Помимо своей ключевой роли в клеточном дыхании, железосодержащий гем с порфириновым кольцом участвует в функции множества ферментов, таких как каталазы и синтаза оксида азота (Choby and Skaar, 2016). В этом свете несинонимичный m

.

Определение туляремии в Медицинском словаре

Туляремия

Определение

Туляремия — это заболевание, вызываемое бактериями. Это приводит к лихорадке, сыпи и значительному увеличению лимфатических узлов.

Описание

Туляремия поражает различных диких животных, включая кроликов, оленей, белок, ондатру и бобра. Люди могут заразиться бактерией непосредственно при контакте с кровью или биологическими жидкостями этих животных, от укуса клеща или мухи, которые ранее питались кровью инфицированного животного, или от зараженной пищи или воды.

Туляремия чаще всего возникает в летние месяцы. Скорее всего, он заразит людей, вступающих в контакт с инфицированными животными, включая охотников, меховщиков, мясников, лабораторных работников, охотников и ветеринаров. В Соединенных Штатах подавляющее большинство случаев туляремии происходит в юго-восточных штатах и ​​штатах Скалистых гор.

Причины и симптомы

В зависимости от того, где и как бактерии попадают в организм, могут возникать пять типов заболеваний:

• Ульцерогландулярная / железистая туляремия.От 75 до 85% всех случаев относятся к этому типу. Этот тип заражается при укусе инфицированного клеща, испражнявшего богатые бактериями фекалии в области укушенной раны. В области первоначальной раны появляется нежная красная шишка. Через несколько недель на шишке образуется выбитый центр (язва). Соседние лимфатические узлы сильно опухают и становятся очень болезненными. Из лимфатических узлов может стекать густой гнойный материал. Другие симптомы включают жар, озноб и слабость. У взрослых чаще всего поражаются лимфатические узлы в паху; у детей лимфатические узлы на шее.
• Окулогландулярная туляремия. На этот тип приходится всего около 1% всех случаев туляремии. Это происходит, когда зараженная рука трет глаза. Подкладка век и поверхность белого глаза (конъюнктива) становится красной и сильно болезненной, с множеством небольших желтых бугорков и изъязвленных язв (язв). Лимфатические узлы вокруг ушей, под челюстью или на шее могут опухать и становиться болезненными.
• Орофарингеальная и желудочно-кишечная туляремия.Этот тип возникает, когда зараженное мясо недоварено и затем съедено, или когда выпивается вода из зараженного источника. Плохая гигиена после снятия шкуры и очистки животного, добытого во время охоты, также может привести к проникновению бактерий через рот. Могут возникнуть язвы во рту и горле, а также боль в животе, тошнота и рвота, язвы в кишечнике, кишечное кровотечение и диарея.
• Легочная туляремия. Этот редкий тип туляремии возникает, когда человек вдыхает струю инфицированной жидкости или когда бактерии попадают в легкие через кровообращение.За этим следует тяжелая пневмония.
• Тифоидная туляремия. Этот тип туляремии особенно сложно диагностировать, потому что он возникает без обычных кожных проявлений или увеличения лимфатических узлов. Симптомы включают постоянную высокую температуру, ужасную головную боль и спутанность сознания. Заболевание может привести к очень низкому кровяному давлению с признаками плохого притока крови к основным органам (шок).

Диагностика

Образцы кожных поражений могут быть приготовлены со специальными красителями, что позволит идентифицировать бактерии-возбудители под микроскопом.Доступны и другие тесты для демонстрации наличия антител (особых иммунных клеток, которые вырабатываются организмом в ответ на присутствие определенных чужеродных захватчиков), количество которых со временем будет увеличиваться при заражении туляремией.

Лечение

Стрептомицин (в виде укола в мышцу) и гентамицин (в виде укола в мышцу или через иглу в вену) используются для лечения туляремии. Были протестированы другие типы антибиотиков, но они часто приводили к относительно высокому уровню рецидивов (20%).

Прогноз

При лечении смертность от туляремии составляет менее 1%. Однако без лечения смертность может достигать 30%. Пневмония и брюшной тиф имеют худший прогноз без лечения.

Профилактика

Профилактика включает в себя избегание районов, в которых обитают клещи и мухи, или соответствующее использование репеллентов от насекомых. При снятии шкуры с животных или приготовлении мяса охотникам следует носить перчатки. Остальные (мясники, охотоведы, ветеринары), работающие с животными или тушами, всегда должны носить перчатки.Вакцина существует, но обычно ее делают только людям с очень высоким риском в связи с их профессией или хобби (ветеринары, лабораторные работники, мясники, охотники, инспекторы охоты).

Ресурсы

Организации

Центры по контролю и профилактике заболеваний. 1600 Clifton Rd., NE, Atlanta, GA 30333. (800) 311-3435, (404) 639-3311. http://www.cdc.gov .

Ключевые термины

Конъюнктива — Выстилка век и поверхность белой части глаза. Шок — Состояние, при котором резко низкое кровяное давление препятствует адекватному притоку крови к тканям и органам по всему телу.

туляремия

[too ″ lah-re´me-ah] чумная болезнь грызунов, вызываемая Francisella tularensis, , которая передается человеку. Он может быть заразен при контакте с больными животными или их шкурами, поеданием инфицированной дичи или при укусе насекомых, таких как слепни или оленьи мухи, которые питались такими животными.

Симптомы и лечение.Туляремия начинается с внезапного появления озноба и лихорадки, сопровождающихся головной болью, тошнотой, рвотой и сильной слабостью. Примерно через день на месте инфекции обычно появляется небольшая язва, которая становится изъязвленной. Также может наблюдаться увеличение и изъязвление лимфатических узлов и генерализованная красная сыпь. При отсутствии лечения лихорадка может длиться недели или месяцы. Лечение проводится антибиотиками, такими как тетрациклин, стрептомицин и хлорамфеникол.

Профилактика. Туляремию обычно считают профессиональным заболеванием.Те, кто может подвергнуться его воздействию, например, смотрители дичи и охотники, должны принимать меры предосторожности, например надевать перчатки при обращении с дикими животными, особенно кроликами и белками, и носить соответствующую одежду в лесу, чтобы предотвратить укусы насекомых-переносчиков болезни. Чтобы убить туляремию, дичь нужно особенно хорошо приготовить.

tu · la · re · mi · a

(tū’lă-rē’mē-ă),

Болезнь, вызываемая Francisella tularensis и передающаяся человеку от грызунов через укус оленьей мухи, Chrysops discalis и другие кровососущие насекомые; также могут передаваться непосредственно через укус инфицированного животного или при обращении с тушей инфицированного животного; Симптомы, подобные симптомам волнообразной лихорадки и чумы, представляют собой длительную перемежающуюся или ремиттирующую лихорадку и часто опухание и нагноение лимфатических узлов, дренирующих очаг инфекции; кролики — важный резервуарный хозяин.

[ Туларе, Лейк энд Каунти, Калифорния, + G. Хайма, кровь]

.